Ніяк. Бо не існує єдиного "шляху для встановлення", програма в *NIX розкидається по купі тек (ігри, зазвичай, у вторинну ієрархію /usr - виконані файли в /usr/bin, різні медіафайли - в /usr/share і т.д.).
Зате можна перемонтувати будь-яку теку на інший розділ - наприклад, можна виділити розділ під /usr, скопіювати туди наявні файли і перемонтувати цей розділ через fstab в теку /usr, а файли в оригінальній /usr видалити (при монтуванні вони маскуються).
А взагалі треба було десь хоча б гігабайт 20 під Ubuntu виділяти.

Типу як в /opt/google ?

koala
Наприклад щоб мати дві версії однієї програми. Слава Богу, що зараз з'явилися Snap та Flatpak.

видаліть всі збережені програми чи розархівовані, не знаю як там в убунту, але в FreeBSD, ports якщо не зробити clean от так 

# make install clean

то тоді видаляється папка work та всі *о, *.so і залишаються текстові файли, я так раз був загадив систему. Та коли появивися pkgng там зробили таку команду

 # pkg clean 

де чистить програми які були видалені з списку программ, але пони залишились в

/var/db/pkg

Всі tgz архіви там були, спробуйте, щось аналогічне повинно бути і в пакетному менеджері убунти

Ви впевнені, що ті 25 гб займає саме система, а не користуваціькі данні? Я гадаю, що всі програми з системою  важать не більше 10 ГБ, а інше - різні хвільми.

Впевнений. Для власних даних є диск D. Простір під Убунту зайнятий програмами, wine і ще кількома іграми. Все зайняло 16 гб. Вільно 7.8 гб. Розмір оновлень ~600 мб. Але функція df -h окрім /media/Data (діск D) і /dev/sda5 (Ubuntu) виводить ще додаткові каталоги /dev; /run; /dev/shm; /run/lock; /sys/fs/cgroup; /run/user/1000 у яких є по кілька гігабайт чи мегабайт з яких вільно декілька відсотків. Після встановлення оновлень в корені (/dev/sda5) вільне місце зменшилося лише на трохи, а в інших каталогах вільного місця немає і (ймовірно через це) система не грузиться. Але в будь якому випадку дякую, що хоча б щось відписали. Можливо хтось, хто розуміється зможе чимось мені допомогти?

du: не вдалося отримати доступ до './usr/lib/jvm/java-8-openjdk-amd64/jre/lib/rt.jar': Структура потребує чищення
du: не вдалося отримати доступ до './proc/13932/task/13932/fd/4': Немає такого файла або каталогу
du: не вдалося отримати доступ до './proc/13932/task/13932/fdinfo/4': Немає такого файла або каталогу
du: не вдалося отримати доступ до './proc/13932/fd/3': Немає такого файла або каталогу
du: не вдалося отримати доступ до './proc/13932/fdinfo/3': Немає такого файла або каталогу
du: не вдалося отримати доступ до './run/user/1000/gvfs': Відмовлено у доступі

там же на моніторі написано про виконання fsck

ввести команду

fsck -y 

, але це У автопогодження, без натискань У