щось всі кидають посилання на стандарти але ніхто не поспішає показати як пише код саме він! Я не знаю яких я стандартів дотримуюся але зараз на роботі до мене претензій по коду ще не було. Можу перелічити кілька речей яких я дотримуюся, ними є: 
верблюжа нотація при неймінгу (перша буква першого слова маленька, кожна перша буква наступних слів велика);
function filterByName()
var userAddress;
 
намагаюся називати змінні осмислено;
$postalCode = "10091";
$totalPrice   += (double) $orderItem["price"];
 
виділяю табуляцією кожен дочірній блок коду зберігаючи ієрархію;
function filterByName($a, $b){
    for($i = 0; $i < 100; $i++){
        if($a != $b) {
            $a = $b;
        }
    }
    $a /= 2;
    for($i = 0; $i < 100; $i++){
        $a *= $b;
    }
}
намагаюся при можливості використовувати скорочений синтаксис умовного оператора;
$c = ($a == $b) ? $b : $a;
в шаблонах намагаюся використовувати скорочений синтаксис оператора echo;
<a href="http://google.com.ua"><?=$ancor?></a>
намагаюся не виводити великі шматки html через оператор echo;
<?php if($good) {?>
<a href="http://google.com.ua"><?=$ancor?></a>
<?php } ?>
Існує ще достатньо багато нюансів яких я дотримуюся але на разі їх не пригадаю. Для ООП свої стандарти, для SQL свої, для javaScript можуть бути свої відмінності у порівнянні із php і т.д.
п.с. я б радив початківцям незнайомим із жодними стандартами почати із стандартів мови Java (Code Conventions for the Java Programming Language).